Новое приложение позволяет анализировать ДНК на обычном смартфоне.

Новое приложение превращает смартфон в анализатор генома

Специалисты создали программу, которая позволяет анализировать геном с помощью iPhone. В сочетании с миниатюрным прибором для секвенирования ДНК и РНК гаджет превращается в карманную генетическую лабораторию.

Удивительная разработка описана в научной статье, опубликованной в журнале Gigascience.

Технологии секвенирования («чтения») ДНК и РНК развиваются стремительно. Ещё несколько лет назад новинкой были секвенаторы, весящие меньше трёх килограммов. Сегодня же компания Oxford Nanopore предлагает устройство, которое умещается в ладони и весит менее ста граммов.

Однако секвенатор выполняет только биохимическую («мокрую») часть расшифровки генома. Полученные на нём данные нужно обработать, и эта обработка требует внушительного количества вычислений. Ещё недавно для этого нужен был как минимум высокопроизводительный ноутбук, а то и целый сервер.

Теперь же нужные расчёты может выполнить обычный смартфон. Правда, пока новая программа доступна лишь для пользователей iPhone. Тестирование на множестве геномов показало, что по производительности она сравнима с популярными среди специалистов аналогами, работающими на «больших» устройствах.

Разработчик приложения iGenomics Асприн Палатник держит в руках карманную генетическую лабораторию: в правой – iPhone, а в левой – секвенатор генома.

Пользователю требуется лишь установить бесплатное приложение iGenomics и подключиться к секвенатору по беспроводной связи.

Разработчики подчёркивают, что все вычисления выполняются исключительно на самом гаджете, а не на удалённых серверах. Поэтому iGenomics может работать даже без доступа к Интернету.

Имея карманный секвенатор и iPhone с установленным на нём iGenomics, биолог практически носит с собой генетическую лабораторию. Это означает, что он может заниматься чтением генетических данных в любом уголке земного шара.

К слову, это особенно важно для оперативной борьбы с вирусами, в том числе и SARS-CoV-2. Разработчики даже опубликовали онлайн-руководство по расшифровке геномов вирусов.

Приложение iGenomics имеет открытый исходный код. Так что в скором будущем можно ожидать выхода таких же программ, работающих на других гаджетах.

Напомним, что ранее Вести.Ru рассказывали о приложениях и устройствах, позволяющих с помощью смартфона проверить зрение и даже качество спермы, а также превращающих гаджет в микроскоп.

По материалам сайта vesti.ru
По материалам сайта vesti.ru

Сетевое издание "Вести.Ру". Учредитель: Федеральное государственное унитарное предприятие "Всероссийская государственная телевизионная и радиовещательная компания" (ВГТРК). Свидетельство о регистрации СМИ ЭЛ № ФС 77-72266 от 24.01.2018. Выдано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций.

Оставить комментарий

Ваш адрес электронной почты не будет опубликован. Обязательные для заполнения поля отмечены *